剧场版第三部原名“魔法少女リリカルなのは The MOVIE 3rd :Reflection”，又译作“The MOVIE 3rd Reflection”。讲述有一对负责研究“行星重生”的夫妇和两个女儿一起生活在Eltria（エルトリア）的世界中。当Eltria世界快接近于毁灭危机的时候，父亲不幸病倒了。两女儿之中的妹妹yrie Florian为了救助父亲和“行星重生”的研究，把希望寄托在了“遥远的异世界（遥か远い异世界）”上。而另一位大女儿Amitie Florian作为姐姐得知后就出面阻止yrie。最终来自Eltria世界的Amitie、Kyrie和Iris（イリス）等三人的行为一直影响到了高町奈叶、菲特·T·哈洛温、八神疾风等人所生活的世界“地球”上来了。 “决意要伸出援手，不惜为此堵上一切！承载着两个世界的未来，剑与魔导火光四射。”——《魔法少女奈叶Reflection》第一期宣传片中的字幕。 “被唤醒的，是来自过往的命运。苏醒的三道灵魂，将踏上各自的道路。心愿只有一个。要守住‘那天的誓言’，以及连接两个世界的坎坷宿命。这是个勇敢面对宿命与悲伤的少女们的故事。”——《魔法少女奈叶Reflection》第二期宣传片中的字幕
